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盡管幾乎所有局部感染均可播散至血液中,但有關菌血癥和真菌血癥的系統性研究表明,最常見的原發病灶是血管內裝置(主要是導管)、呼吸道、泌尿道和腹腔內。雖然醫生們盡力尋找感染灶,但仍有1/3至1/4的患者無法最終確定感染來源。
隨著中心或外周靜脈逐漸普遍用于長期化療或胃腸外營養,血管內導管作為菌血癥和真菌血癥來源的重要性也日益突出。同時,那些毒力較低的可“粘附”微生物,如凝固酶陰性葡萄球菌,由于能夠附著在導管材料表面,也逐漸成為菌血癥主要的病原菌。