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理論上,菌血癥可以分為一過性、間斷性或持續性。過性菌血癥最為常見,持續數分鐘至數小時,通常在對感染組織進行操作、手術、對有微生物污染或定居的粘膜表面進行操作時發生。在急性細菌性感染如肺炎、腦膜炎、感染性關節炎和急性血行性骨髓炎時也可出現間斷性菌血癥是指在同一患者由同一致病菌引起的菌血癥發生、消除和復發的現象。這種菌血癥通常伴有未經引流的密閉體腔感染如腹腔內膿腫,但在局部感染如肺炎和骨髓炎的患者也可出現持續性菌血癥在感染性心內膜炎以及其它血管內感染(化膿性血栓性靜脈炎,感染性動脈瘤)最為典型,在布魯氏菌病和傷寒早期也可出現。
菌血癥也可分為單一致病菌和多重致病菌,后者占6%-18%。