近期來自華中科技大學生命科學與技術學院的研究人員在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)雜志(IF 7.8)上發表了題為"MicroRNA and transc**tion factor co-regulatory network analysis reveals miR-19 inhibits CYLD in T-cell acute lymphoblastic leukemia"的研究論文,報告了關于急性T淋巴細胞白血病中miRNA和轉錄因子共調控網絡的生物信息學研究的最新成果。
領導這一研究的是華中科技大學生命科學與技術學院的郭安源教授,主要從事生物信息學和系統生物學在復雜疾病中的研究,包括數據整合、數據庫構建、miRNA調控、比較基因組學和二代測序數據的分析研究等。
急性T淋巴細胞白血病(T-ALL)是一種進行性的血液系統惡性疾病,以高外周血細胞計數、原始細胞增多、中樞神經系統浸潤和縱隔腫瘤為特征,好發于兒童和青少年。當淋巴母細胞(一種未成熟的白細胞)變成惡性、不受控制地增殖并迅速擴散至全身時,T-ALL便發生了。該疾病進展兇險,如果不進行治療,疾病在幾周內就可致命。近年來盡管多藥聯合、大劑量化療等治療手段的不斷改進,以及各類造血干細胞移植的應用和推廣,但是該病的總體療效和預后比更常見的B細胞系淋巴細胞白血病仍然要差很多。目前對于這一疾病發病的具體分子機理和調控機理還不清楚。
在這篇文章中,郭安源教授課題組以miRNA和轉錄因子的共調控角度為切入點,運用生物信息學方法,預測miRNA和轉錄因子與疾病基因之間形成的共調控前饋環模塊,并由此構建共調控網絡。通過深入分析該調控網絡獲得了其中的核心miRNA和基因。并進一步對其中核心基因miR-19與CYLD在T-ALL中的分子機理進行了研究,首次揭示了miR-19抑制CYLD蛋白的產生,繼而激活下游的NFKB信號通路,導致T淋巴細胞增殖失控。
這項研究成果從系統網絡水平研究急性T淋巴細胞白血病的發病機理和調控過程,為其診斷和治療提供理論依據,并為復雜疾病的研究提供了計算和實驗交叉的新思路和方法。
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