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癥狀和體征:鑒別抗生素相關性腹瀉是否由難辨梭狀芽孢桿菌引起十分重要,因為難辨梭狀芽孢桿菌誘發的腹瀉可以產生非常嚴重的并發癥,需要特異性治療措施。但是僅根據床旁檢查不可能作出診斷。表29比較了兩種抗生素相關性腹瀉的不同特點，而言之,兩種腹瀉均可由同一種抗生素引起。然而,難辨梭狀芽孢桿菌引起的腹瀉常常是劑量非依賴性的,停用相關藥物后癥狀通常持續存在。
臨床表現相似,但結腸炎的征象包括發熱、腹痛、白細胞增多和糞便中有白細胞,提示可能為難辨梭狀芽孢桿菌引起難辨梭狀芽孢桿菌引起的腹瀉常發生嚴重的并發癥,包括中毒性巨結腸,腸梗阻,高熱,白血病樣反應,脫水和電解質紊亂等。而且,在很多患者可以出現低白蛋白血癥,并伴發水腫。這種并發癥在20年前甚為普遍,那時偽膜性腸炎的病因和治療都未明確。現在低白蛋白血癥較為少見,除非延誤診斷。內窺鏡下表現:難辨梭狀芽孢桿菌引起的腸道病變,其解剖學表現可以差異很大,如正常結腸,或特發性潰瘍性結腸炎,或偽膜性腸炎。后者是最為典型的表現。
抗生素相關性腹瀉患者的糞便中難辨梭狀芽孢桿菌毒素的檢出率直接與解剖學變化的嚴重程度相關。結腸正常的患者10%~20%毒素檢測陽性,結腸炎患者50%~70%陽性,而偽膜性腸炎患者幾乎100%毒素檢測陽性。表30表明根據糞便標本組織培養分析,不同患者人群中難辨梭狀芽孢桿菌毒素的檢測率。

胃腸道的解剖學改變通常發生在結腸。抗生素相關性腹瀉很少累及小腸。