文獻標題:RIOK3-Mediated Phosphorylation of MDA5 Interferes with Its Assembly and Attenuates the Innate Immune Response.
文獻來源:Cell Rep 2015 Apr 7
天然免疫應答對于抵抗病毒的感染十分重要。RIG-I與MDA-5是最常見的細胞內部識別病毒RNA的信號分子,它們的識別與激活能夠傳遞胞內的抗病毒免疫反應。MDA-5能夠識別較長的雙鏈RNA分子,而RIG-I識別的序列長度較短。
對于MDA-5來講,它由N端的兩個C**結構域,中部的RNA解旋酶結構域以及C端的一個結構域(CTD)構成,其中CTD負責識別胞內的雙鏈病毒RNA分子。隨后,MDA-5圍繞RNA分子通過蛋白-蛋白相互作用彼此頭尾相連,最終形成纖維狀的結構。這一結構能夠促進C**的寡聚化,而寡聚化后的C**復合體則能夠進一步結合位于線粒體上的MAVS蛋白進行信號的傳遞。以前的研究顯示MDA5的活性受到其C**的磷酸化調控,然而內在的分子機制卻仍不清楚,同時C端的功能也同樣不清楚。
最近,來自北海道大學的Tsukasa Seya課題組在《cell report》雜志上發表了他們對MDA-5 C端磷酸化的分子機制以及其作用的相關研究。
首先,作者通過體外的生化實驗證明MDA-5存在磷酸化形式。他們發現在HEK293細胞中過表達的FLAG-MDA-5在SDS-PAGE中移動速度較慢,而在加入磷酸酶CLAP后該蛋白的遷移速度明顯加快。之后的突變分析證明該磷酸化存在于MDA-5的C-端。
為了找到作用于MDA-5的蛋白激酶,作者進行了酵母雙雜交實驗。實驗結果顯示:RIOK3與MDA-5 C-端存在相互作用,后續的免疫共沉淀實驗證明了這一結論。另外,作者還通過共聚焦顯微成像的手段證明了MDA-5與RIOK3存在共定位,而且它們不論在**前后均位于胞漿中,而遠離線粒體。之后,作者通過RNAi的手段人為降低了RIOK3的水平,結果MDA-5的磷酸化程度明顯上升。這一結果說明RIOK3參與了MDA-5的磷酸化。
接下來,作者希望了解RIOK3對MDA-5的磷酸化對于這一信號究竟有什么影響。通過在HEK293中過表達MDA-5與RIOK3,作者發現RIOK3的存在能夠明顯抑制MDA-5過表達帶來的免疫信號增強,然而,MAVS過表達產生的免疫信號并不能被RIOK3所抑制,這說明RIOK3的作用產生在MAVS的上游。另外,作者通過RNAi人為下調HEK293細胞中RIOK3的表達量以及使用RIOK3敲除的HEK293細胞進行實驗也得到了相同的結論。
之后,作者利用突變分析的手段證明了RIOK3特異性磷酸化MDA-5在828位的絲氨酸。另外,作者還通過生化實驗證明了RIOK3對MDA-5的磷酸化抑制了其在激活條件下形成多聚體的活性。綜上,通過一系列生化試驗,作者證明了一個新的抗病毒免疫調控機制。
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