由深圳華大基因研究院、深圳市第二人民醫院(簡稱市二院)等單位組成的科研團隊,通過對99個膀胱癌患者樣本進行全基因組及全外顯子測序研究,發現了與姐妹染色單體結合及分離(sister chromatid cohesion and segregation, SCCS)相關的基因突變,為膀胱癌診斷、治療提供了新思路。最新研究成果于2013年10月13日在《自然。遺傳學》(Nature Genetics)雜志上發表。
膀胱癌發病率居泌尿系統惡性腫瘤的首位,而在西方國家其發病率僅次于前列腺癌,居第2位。膀胱移行細胞癌(TCC)是膀胱癌中最常見的組織學類型,男性發病率約為女性的3——4倍,多發生于40-70歲之間。目前,中國男性膀胱癌的年發病率已達十萬分之八,并呈逐年上升的趨勢。對于這一重要癌癥,目前卻沒有充足的基因組學數據供科研人員開發新的治療方法以攻克膀胱癌。
來自華大基因和市二院的科研人員對99個膀胱癌患者的組織樣本進行了全基因組測序和全外顯子測序,共發現13個重要的新突變基因和24個已知突變基因如TP53,HRAS, FGFR3,PIK3CA以及KRAS等。在所發現的新突變基因中,位于X染色體上的STAG2基因顯得尤為特別,該基因與SCCS過程息息相關。科研人員發現STAG2基因發生了高頻非同義突變,并且11個發生該基因突變的樣品中有9個都是終止突變。此外,與SCCS相關的ESPL1基因也發生了高頻突變。
研究人員還通過轉錄組測序對42對組織樣品進行了研究,結果發現有32個潛在的基因重排可能會導致基因融合,并證實FGFR3和TACC3基因發生了融合。研究還發現,TACC3的高表達不是TACC3基因自身的擴增導致的,而是通過FGFR3這個轉錄調控因子來調節的。
此外,研究結果顯示染色體的非整倍體性及不穩定性與膀胱癌發生有關,并使膀胱癌成為首個擁有SCCS相關基因突變的癌癥。此外,本研究為膀胱移行細胞瘤提供了更全面綜合的基因組突變信息,并證明基因突變可影響SCCS過程,同時為膀胱癌的診斷治療提供了一種新的可能性。
華大基應該項目負責人陳超指出:“在這次研究中,我們發現了多個與SCCS相關的突變,包括STAG2、ESPL1基因的高頻突變以及FGFR3-TACC3基因融合。這一發現證實SCCS相關基因突變確實與膀胱癌的發生有關,極大地推動了膀胱癌遺傳學研究,同時也為膀胱癌的診斷治療提供了新思路。此外,研究中所獲得的數據資源也為以后膀胱癌的深入研究奠定了重要的科研基礎。”
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