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新一代DNA測序技術助力癌癥抗原篩查

2013-06-27 11:00 閱讀:1879 來源:生物360 作者:網* 責任編輯:網絡
[導讀] 日前,美國國家癌癥研究所等機構的科學家們開發出了一種新的流線化方法,可快速鑒別出黑色素瘤中可被腫瘤浸潤淋巴細胞識別的獨特突變抗原。過去的研究證實腫瘤浸潤淋巴細胞能夠減少癌癥病變,這些獨特的蛋白小片段是腫瘤浸潤淋巴細胞的識別靶標。

    日前,美國國家癌癥研究所等機構的科學家們開發出了一種新的流線化方法,可快速鑒別出黑色素瘤中可被腫瘤浸潤淋巴細胞識別的獨特突變抗原。過去的研究證實腫瘤浸潤淋巴細胞能夠減少癌癥病變,這些獨特的蛋白小片段是腫瘤浸潤淋巴細胞的識別靶標。
 


    此前的一項 2 期臨床試驗顯示,70% 的黑色素瘤患者接受自體腫瘤浸潤淋巴細胞治療,可導致轉移病灶顯著消退。

    在這項最新研究中,科學家對患者過繼轉移了自身的免疫細胞,近 40% 的患者在至少 5 年的時間內腫瘤完全消退。為了更好地了解它的作用機制,研究人員開發了一種新方法,有助于更快地篩查出這些腫瘤浸潤淋巴細胞識別的突變抗原。

    腫瘤浸潤淋巴細胞是指那些離開血流進入到腫瘤中的白細胞。當存在大量的腫瘤浸潤淋巴細胞時,表明機體啟動了對抗腫瘤的免疫反應。在許多的癌癥中,研究人員均開展了相關的研究,定量這些腫瘤浸潤細胞,并將其數量與腫瘤特征和結果關聯起來。

    研究人員認為,更好地了解腫瘤浸潤淋巴細胞誘導癌細胞消退的機制,將提高患者自體移植細胞治療的效力,并且有可能揭示出腫瘤生長新機制。

    研究人員指出,新技術能夠更快、更容易地鑒別出免疫系統T細胞識別的突變基因抗原。從前,研究人員都是通過生成以及費力地篩查來自腫瘤的DNA庫,來完成這樣的工作。這一新篩查技術有可能還適用于在許多癌癥類型中鑒別突變抗原。

    新方法采用了新一代 DNA 測序技術,挖掘全外顯子序列數據,鑒別在患者中表達的突變蛋白。隨后研究人員合成出候選的突變T細胞抗原表位,并用一種主要組織相容性復合物結合算法對候 選表位進行了評估。利用這種方法,研究人員鑒別出了在患者腫瘤細胞上表達,能被腫瘤浸潤淋巴細胞識別的突變抗原。


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