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科學家發現漢族人發現了兩個新的宮頸癌易感位點

2013-10-23 22:08 閱讀:1985 來源:生物通 作者:網* 責任編輯:網絡
[導讀] 為了鑒定宮頸癌的遺傳風險因素,華中科技大學同濟醫學院等多家機構的研究人員在漢族人群中開展了全基因組關聯研究(GWAS),發現了兩個新的宮頸癌易感位點.這項研究成果于8月發表在《Nature Genetics》雜志上.領導這一項研究的是華中科技大學的馬丁教授.

    一提起宮頸癌,大家首先想到的罪魁禍首肯定是人乳頭瘤病毒(HPV).這是一種常見的病毒,通過性接觸傳播.然而,大部分HPV感染可自行消退,只有不到4%的個體會發展成持續感染,進而有可能發展成癌前病變或癌癥.這表明,宿主遺傳特征和病毒之間也存在著復雜的關系.

    為了鑒定宮頸癌的遺傳風險因素,華中科技大學同濟醫學院等多家機構的研究人員在漢族人群中開展了全基因組關聯研究(GWAS),發現了兩個新的宮頸癌易感位點.這項研究成果于8月發表在《Nature Genetics》雜志上.領導這一項研究的是華中科技大學的馬丁教授.

    在發展中國家,宮頸癌是導致婦女死亡的最主要的惡性腫瘤之一.大量的流行病學和臨床證據表明,高危型HPV的持續感染是主要的風險因素,也是發展成宮頸癌所必需的;在99.7%的宮頸癌病例中檢測到HPV感染.然而,單純的HPV感染卻不足以引起腫瘤發展,大部分感染可自行消退.種種跡象表明,宮頸癌也與遺傳因素和外部環境因素相關.

    于是,研究人員在漢族人群中開展了大規模的GWAS研究.首先在發現階段,他們利用Affymetrix的Axiom Genome-Wide CHB1芯片對1,364個病例和3,028個女性對照進行了基因分型.Axiom Genome-Wide CHB1是一款專為漢族人群而設計的芯片,其內容精選自Axiom基因組數據庫,最大限度地覆蓋了常見的等位基因(MAF >5%).在這一階段,研究人員總共發現了41個明顯關聯的SNP.

    之后,他們對這41個SNP位點中的22個(其中忽略的19個處于連鎖不平衡狀態)進行了第二階段的跟進研究.這一階段包括兩個獨立的樣本組:第一組包括1,824個病例和3,808個對照;第二組包括2,343個病例和3,388個對照.對于第一組,22個SNP中的13個是統計學上顯著的.隨后,他們又對第二組開展了這13個SNP的基因分型.

    綜合這三個階段的結果,研究人員發現了2個新的SNP位點(rs1311117307和rs8067378),它們所在或鄰近的染色體區域(EXOC1[4q12]和GSDMB[17q12])是宮頸癌的易感區域.同時,研究人員也確認了之前鑒定出的一個位點(rs4282438),它定位在6p21.32上的HLA-DPB1和HLA-DPB2之間(HLA-DPB1/2).

    研究人員認為,EXOC和GSDMB區域,以及HLA-DP等位基因中易感位點的確定,表明T細胞介導的免疫反應或腫瘤細胞增殖可能發揮了重要的作用.這些遺傳因素可能影響HPV持續感染和整合的機制,從而與宮頸癌風險相關.這一發現為宮頸癌的遺傳病因提供了新的見解,對癌癥的預防和治療具有重要意義.


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